Bản quyền là cơ chế bảo hộ quyền tác giả đối với chương trình máy tính; quyền kiểm soát mã nguồn là vấn đề rộng hơn, gắn với quyền tài sản, hợp đồng, bí mật kinh doanh và quản trị truy cập. Có giấy chứng nhận bản quyền không đồng nghĩa mọi tranh chấp về quyền truy cập source code tự động được giải quyết.
Trong phần mềm gia công, quyền đăng ký phụ thuộc vào quan hệ hợp đồng, tư cách tác giả và thỏa thuận về quyền tài sản. Hợp đồng nên quy định rõ quyền đối với source code, tài liệu kỹ thuật, quyền sửa đổi và quyền đăng ký.
Với freelancer, quyền đối với phần mềm cần được xác định bằng hợp đồng và căn cứ pháp luật, không nên mặc định rằng bên thuê đương nhiên sở hữu toàn bộ quyền chỉ vì đã thanh toán tiền. Hợp đồng nên quy định rõ tác giả, chủ sở hữu, quyền tài sản, mã nguồn và quyền sửa đổi/phát triển.
Không thể chỉ dựa vào việc ai viết code để kết luận ai là chủ sở hữu quyền tài sản. Doanh nghiệp cần xem hợp đồng lao động, nhiệm vụ được giao, thỏa thuận về quyền tài sản và quy định pháp luật áp dụng cho tác phẩm do nhân viên tạo ra trong quá trình thực hiện công việc.
Đăng ký quyền tác giả cho phần mềm nhằm xác lập chứng cứ về quyền đối với chương trình máy tính; nó không đồng nghĩa với việc đăng ký độc quyền mọi ý tưởng, chức năng kinh doanh hoặc công nghệ đứng phía sau phần mềm. Source code cần được quản lý theo đúng chiến lược bảo mật và hồ sơ đăng ký.
Hồ sơ đăng ký quyền tác giả cho chương trình máy tính cần chứng minh được tác phẩm, tác giả và chủ sở hữu quyền. Với phần mềm, phần thể hiện chương trình và tài liệu kèm theo cần được chuẩn bị theo yêu cầu hiện hành; doanh nghiệp không nên mặc định rằng phải công khai toàn bộ mã nguồn trên website hoặc trong hồ sơ thương mại.
Ủy quyền chuyển nhượng nhãn hiệu giúp đại diện sở hữu công nghiệp thực hiện việc kiểm tra hồ sơ, chuẩn bị tài liệu, nộp và theo dõi thủ tục. Phạm vi ủy quyền cần đủ để xử lý cả việc đăng ký hợp đồng và phản hồi yêu cầu của cơ quan có thẩm quyền.
Hồ sơ có thể gặp vấn đề nếu bên chuyển nhượng không phải chủ văn bằng, giao dịch xâm phạm quyền của bên thứ ba, hoặc hồ sơ không đáp ứng điều kiện pháp lý. Các trường hợp có nhiều hợp đồng hoặc nhiều bên nhận cũng cần kiểm tra đặc biệt.
Chuyển nhượng quyền sở hữu nhãn hiệu không phải là một lần đăng ký mới để tạo ra một thời hạn bảo hộ mới. Bên nhận tiếp nhận quyền đối với văn bằng đang tồn tại theo phạm vi được chuyển nhượng; thời hạn bảo hộ của văn bằng cần được quản lý tiếp.
Khi doanh nghiệp giải thể, cần xử lý tài sản trí tuệ trước khi hoàn tất các bước chấm dứt pháp nhân nếu nhãn hiệu còn giá trị thương mại. Việc chuyển quyền phải xác định đúng người có thẩm quyền và căn cứ pháp lý của giao dịch.